Genome Sequence Alignment and Reliability

김재범
교수
건국대학교 동물생명공학과
주최: 
서울대-삼성전자 SW 공동연구센터 (CIC)
일시: 
2012년 4월 13일 금요일 AM 10:30
장소: 
301동 551호

요약

한 생물이 가지는 모든 유전 정보를 의미하는 유전체 (genome) 연구는 생물의 다양성 및 질병 이해를 위하여 필수적입니다. 아울러 유사한 생물 종들의 유전체 비교 또는 같은 생물군에 속하는 여러 개체의 유전체 비교 연구는 유전체 정보 이용의 효용성을 극대화 하고 있습니다. 최근 생명공학 기술의 눈부신 발전으로 인하여 우리는 낮은 비용으로 빠른 시간 안에 인간을 비롯한 여러 생물의 디지털화된 유전체 염기서열 (genome sequence) 정보를 얻을 수 있게 되었으며, 유전체 정보의 비교 연구 (comparative genomics) 를 위해서 종들간 염기서열의 정렬 (sequence alignment) 은 핵심적이고 필수적인 단계입니다. 이 문제를 해결하기 위하여 많은 컴퓨터 생명공학자들이 서로 다른 알고리즘들을 개발해 오고 있으나 완벽한 염기서열 정렬을 얻어내기에는 아직 부족한 실정입니다. 이러한 측면에서 본 세미나에서는 유전체 염기서열 정렬의 현황 및 문제점 및 이를 극복하기 위하여 최근 개발된 염기서열 정렬의 평가 기법에 대하여 살펴봅니다. 아울러 해당 기법이 어떻게 유전체 정보 이용 및 더 나은 염기서열 정렬을 위하여 응용될 수 있는지를 논의합니다. 본 세미나는 컴퓨터공학 분야에서 생명공학 데이터의 이용을 소개하는 좋은 예가 될 것입니다.

연사 소개

  • 2012 ~: 현재 건국대학교 동물생명공학과 조교수
  • 2010 ~ 2012: University of Illinois at Urbana-Champaign, Institute for Genomic Biology, 박사 후 연구원
  • 2002 ~ 2004: 육군사관학교 전산학과 전임강사
  • 2001 ~ 2002: 육군사관학교 전산학과 강사